Dags för ett popquiz: vad är vetenskapliga Linux-distributioner?
Svaret är ganska uppenbart: medan de flesta Linux-distributioner är generella, kommer vissa specialiserade med vissa typer av programvara. Till exempel finns det distributioner av mediacenter, de som gör din dator till en multimediaproduktionsstudio och till och med några religiösa distributioner. När du vet det borde det inte förvåna dig att det finns vetenskapliga Linux-distros. Trots allt började Linuxs historia i forskningslabb, och idag driver Linux servrarna och arbetsstationerna hos världens största forskningsorganisationer.
Enkelt uttryckt erbjuder vetenskapliga distros förinstallerad programvara för olika forskningsändamål. Naturligtvis kan du förvandla din vanliga Ubuntu till en vetenskaplig distro genom att installera samma appar, men poängen med sådana distributioner är att undvika att leta efter individuella applikationer. Istället erbjuder de ett snabbt sätt att distribuera Linux i forskningsanläggningar, utbildningsinstitutioner och på personliga datorer för studenter och vetenskapsnyfikna användare. Om du är bland de sistnämnda, här är fem fantastiska vetenskapliga distros att överväga.
Denna grönfärgade distro riktar sig till forskare som arbetar inom bioinformatik – ett tvärvetenskapligt område som kombinerar molekylärbiologi och genetik med statistik och analysmetoder från datavetenskap. Utvecklat vid Environmental Omics Synthesis Centre i Storbritannien, stöds och finansieras Bio-Linux av Centre for Ecology & Hydrology (CEH) och Natural Environment Research Council (NERC).
Det är en Ubuntu-baserad distribution endast tillgänglig för 64-bitars system, och den erbjuder två skrivbordsmiljöer: Unity som standard och MATE som ett lättviktigt alternativ. Den senaste versionen (8.0.5) garanterar långsiktigt stöd tack vare dess Ubuntu 14.04-kärna. Bio-Linux 8 innehåller bokstavligen hundratals bioinformatiska verktyg, både kommandorad och grafiska. För att hjälpa dig komma igång erbjuder Bio-Linux en PDF-guide.
Programvaruhöjdpunkter: Artemis, en DNA-sekvensvisare och anteckningsapp; Galaxy, en webbläsarbaserad biomedicinsk forskningsplattform; Fasta, för sökning av DNA- och proteindatabaser; Mesquite, för evolutionär biologi; njplot, för att rita fylogenetiska träd, och Rasmol, för att visualisera makromolekyler. Om du vill installera paket från Bio-Linux på ditt Ubuntu-baserade system kan du helt enkelt lägga till deras förråd.
Bio-Linux finns för free som en Live-bild och som en OVA-fil om du vill köra den i VirtualBox.
Alternativ: BioSLAX, en Slackware-baserad vetenskaplig distribution fokuserad på bioinformatik och utvecklad vid National University of Singapore.
Liksom Bio-Linux har Poseidon Linux också ett färgschema: milda blå toner som matchar dess marina namn. Varumärket var inspirerat av oceanologer som arbetar med projektet, men Poseidon Linux är inte för bara en vetenskapsgren. Istället erbjuder den ett brett utbud av verktyg, från 2D- och 3D-visualisering, genetik och programmeringsappar till stöd för statistik, numerisk modellering och kartläggning.
Poseidon Linux är resultatet av ett transatlantiskt samarbete mellan Rio Grande Federal University i Brasilien och MARUM-institutet i Tyskland. Den nuvarande stabila versionen (4.0) släpar efter tiden, eftersom den är baserad på Ubuntu 10.04. Poseidon 5.0 är dock under utveckling och det lovar långsiktigt stöd (förlitar sig på Ubuntu 12.04) och Unity som standardskrivbordsmiljö – en välkommen uppgradering från den gamla GNOME 2.30 som kommer med Poseidon 4.0.
Programvaruhöjdpunkter: Lab Plot, för interaktiv grafritning och dataanalys; QCAD, för 2D-ritning; Blender, för 3D-modellering, och QGIS, ett komplett geografiskt informationssystem.
Du kan ladda ner Poseidon Linux för free i både 32- och 64-bitarsutgåvor.
Alternativ: Om du bara behöver geografi och kartverktyg, prova OSGeo, en Lubuntu-baserad produkt från Open Source Geospatial Foundation.
3. CAELinux [No Longer Available]
Ledtråden finns i namnet: CAE står för Computer-Aided Engineering, och denna vetenskapliga distro är perfekt för alla som arbetar med CAD, modellering, prototyper, 3D-utskrift och fysiksimuleringar. CAElinux är utvecklat i Schweiz och är baserat på Xubuntu 12.04 och kräver ett 64-bitarssystem. Den erbjuder inga skrivbordssmaker förutom Xfce, men dess programvaruutbud är imponerande.
Programvaruhöjdpunkter: Salome, för 3D CAD och meshing; GMSH, för geometrimodellering; Scilab, för matematisk programmering; Paraview, för 3D-visualisering; ImageJ, för bildbehandling och analys, och Elmer, för komplexa fysiska modeller.
CAElinux är tillgänglig som en Live DVD-avbildning för free, eller så kan du beställa ett fysiskt exemplar till ett överkomligt pris.
Alternativ: Om du inte behöver all avancerad ingenjörsmjukvara och bara vill ha lite 3D-modellerings- och animeringsverktyg, prova ArtistX, som vi täckte in i detalj.
Efter alla dessa *buntu-baserade distros är Scientific Linux en riktig kombinationsbrytare: det är en ombyggnad av Red Hat Enterprise Linux. Den senaste versionen (7.1, kodnamnet Nitrogen) kom ut nyligen, i tre varianter – KDE, GNOME och IceWM – endast för 64-bitars system. Dess bas är dock inte det enda som gör att Scientific Linux sticker ut. Till skillnad från andra distros som är fulla av vetenskaplig programvara, erbjuder Scientific Linux bara en grundläggande uppsättning appar. Vilken lömsk, vilseledande distro!
Tja, inte riktigt. Scientific Linux är faktiskt utvecklat av forskare vid Fermi National Accelerator Laboratory och European Organization for Nuclear Research (CERN). Även om det inte erbjuder många vetenskapliga applikationer som standard, finns det dussintals lätt tillgängliga i arkiven. Med codecs och trådlöst stöd direkt, är Scientific Linux ett utmärkt val för en vetenskaplig miljö där allt förväntas fungera utan alltför mycket mixtrande. Användare kan bara installera den programvara de behöver, så att deras system inte är belamrat med appar som de aldrig ens kommer att öppna.
Programvaruhöjdpunkter: PostgreSQL och MySQL, för databaser och applikationsutveckling; GNU Emacs textredigerare; R programmeringsspråk; Frysk, för systemanalys och övervakning, och gnuplot, för plottning av matematiska uttryck. (Observera att vissa av dessa appar inte kommer att installeras som standard, men du kan hämta dem från arkiven.)
Scientific Linux kan laddas ner som en Live DVD-avbildning.
Alternativ: Utvecklarna av Scientific Linux uppmuntrar skapandet av “spin” eller builds baserat på deras projekt. En sådan distro är Fermi Linux; ett bra, säkerhetsfokuserat alternativ för dig som vill köra Scientific Linux på ett 32-bitarssystem.
Detta Fedora-snurr representerar mellanvägen mellan en högt specialiserad och en vanlig Linux-distribution. Som sådan är det bra för forskare och studenter av alla vetenskapliga bakgrunder, även om det lutar något åt numerisk baserad forskning. Standardskrivbordsmiljön är KDE, och Fedora Scientific är tillgänglig för både 32-bitars och 64-bitars arkitekturer. Det är utvecklat av Amit Saha med stöd av Fedora Science and Technology SIG. Vacker onlinedokumentation kommer att introducera dig till Fedora Scientific och guida dig genom dess programvaruval.
Programvaruhöjdpunkter: Maxima, en komplett algebrasvit; LaTeX, för att skapa dokument och presentationer; Mayavi, för 3D-datavisualisering, och versionskontrolltrifecta: git, Mercurial och Subversion.
Du kan ladda ner Fedora Scientific Live DVD antingen via direkt nedladdning eller som en torrent.
Alternativ: Om du letar efter en användarvänlig vetenskaplig distribution som är fokuserad på matematik, är Mathbuntu en bra ersättare för Fedora Scientific. Det är tillgängligt som en fristående distribution eller som en uppsättning paket för din nuvarande Ubuntu-installation.
Oavsett vilket vetenskapligt område du är intresserad av bör du kunna välja en lämplig distribution från den här listan. Nu, tillbaka till det där popquizet-vilken är din favorit vetenskapliga Linux-distribution? Kan du nämna några andra liknande distributioner som förtjänar en plats på den här listan? Gör dina läxor och dela dina rekommendationer i kommentarerna.
Bildkrediter: Utvald bild, Nagios-baserad övervakningsvägg i NOC via Flickr av Docklandsboy, Poseidon-skärmdump, CAElinux-skärmdump, Scientific Linux via Wikimedia Commons, Fedora Scientific-skärmdump.
Om författaren
Ivana Isadora Devcic (24 artiklar publicerade)
Ivana Isadora är en frilansskribent och översättare, Linux-älskare och KDE-fangirl. Hon stöttar och främjar free & öppen källkod, och hon letar alltid efter fräscha, innovativa appar. Ta reda på hur du kommer i kontakt här.
Mer från Ivana Isadora Devcic
Prenumerera på vårt nyhetsbrev
Gå med i vårt nyhetsbrev för tekniska tips, recensioner, free e-böcker och exklusiva erbjudanden!
Klicka här för att prenumerera
